战锤40K的结局有两种说法：
人类和混沌血战到底，牺牲巨大，失踪源体回归大战混沌，各种族英豪互车，逐渐形成以人类、灵族、钛、死灵为主的秩序派大战混沌，虫子、兽人混操所有人。最终人皇飞升成E神，灵族死神完全复苏，众神混操到永恒之井将物质宇宙和亚空间全部归零。
老的一辈终将逝去，但新的一辈终将在老者的庇护下茁壮成长。战锤40K的结局应该是四神最终毁灭了一切，在一场最终之战后帝皇和人类帝国迎来了壮烈而荣耀辉煌的结局，但旧人类和帝皇的牺牲为新人类留下了火种，在一颗遥远的、不知名的星球上，帝皇留下的冰冷太阳照耀着伊甸园里的一对年轻男女。
